Bis auf wenige Ausnahmen wurde das Fernverkehrsangebot der Bahn zwischen 1999 und 2010 ausnahmslos reduziert oder ganz abgeschafft. Der letzte Höhepunkt im großen Streichkonzert der Bahn in Vorpommern war die Reduzierung der IC-Verbindungen zwischen Rügen, Stralsund, Greifswald und Berlin seit Dezember 2010. Statt täglich fünf gab es seitdem nur noch zwei IC-Verbindungen pro Tag auf dieser Strecke. Ende März kam wochentags ein (Schneckentempo-)ICE von Stralsund nach München über Berlin hinzu. Zusätzlich gibt es unregelmäßig auch einen EC in beide Richtungen.